Examensarbete, 15 hp Biomedicinsk analytikerprogrammet, 180 hp VT 2017
Analys av T-cellsklonalitet
genom fragmentanalys av
T-cellrepertoaren i perifera
mononukleära blod celler
Institutionen för Klinisk mikrobiologi Biomedicinsk laboratorievetenskap Biomedicinsk analytikerprogrammet
Examensarbete, 15 hp
Kursansvarig: Ylva Hedberg Fransson
ylva.hedberg.fransson@umu.se
Läraropponent:
Kristina Lejon
Examinator:Mari Norgren
Datum för godkännande:2017 06 19
Analysis of T Cell Clonality by Fragment Analysis of T Cell Repertoire from Peripheral
Blood Mononuclear Cells
Handledare
Nyckelord
Perifera mononukleära blod celler, typ 1 diabetes, CD247, T-cells receptor V-beta compementarity-determining region 3, fragmentanalys, spectratyping
3
Abstrakt
T-celler produceras i benmärgen och utvecklas i tymus. T-cellers receptor (TCR) utgörs av en α och en β-kedja, var och en med tre hypervariabla regioner (CDR) som tillsammans bestämmer antigen-specificiteten hos cellen. Många genetiska variationer som är associerade med typ 1 diabetes (T1D) är kopplade till funktionen hos immunsystemet såsom CD247-genen. CD247 kodar för CD3ζ subenheten i CD3-komplexet vilket är en viktig del av TCR/CD3-signalering komplexet. Fosforylering av CD3ζ amplifierar signalstyrkan hos T-cellen och spelar därför en viktig roll vid T-cellers aktivering och selektion. Spectratyping är en PCR-baserad metod där olika Vβ används för att amplifiera CDR3 regionen hos TCR. Syftet med denna studie var att etablera och optimera metoden spectratyping för att därefter belysa om varationen i CD247-genen leder till en förändring i fördelning av TCR
