• No results found

System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort. Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-Of-Flight (MALDI ToF) Odling. Odling.

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2022

Share "System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort. Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-Of-Flight (MALDI ToF) Odling. Odling."

Copied!
20
0
0

Loading.... (view fulltext now)

Full text

(1)

Bakteriologisk odling

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Artbestämning Bakterier, jästsvamp

Matrix-Assisted Laser

Desorption/Ionization Time-Of-Flight (MALDI ToF)

Bruker Daltonics – Biotyper system

Eskilstuna Skövde Stockholm

Bact/Alert3D (Blod,Led, Likvor)

Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Bakterier Blod, led, pleuravätska,

CSV, ascites, Abcess, PD-vätska mm

Odling

Bact/Alert Virtuo (Blod,Led, Likvor)

Ingen växt.

Växt av… Stockholm Bakterier Cervix, uretra, Rektum/

anus, Vagina,

Prostatasekret, spiral mm

Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Bakterier Konjunktiva, Hornhinna,

Främre kammare, Glaskropp

Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Bakterier

Nasopharynx, Bihåla/ sinus, Munhåla,

Näsöppning, Hörselgång, Mellanöra mm

Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm

(2)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Bakterier Sputum, Borstprov,

Trachealsekret, BAL mm Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Bakterier

Svalg Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Bakterier Öppet sår, Abscess,

Biopsi/ vävnad, Implantat/

protes, aterom mm

Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm

WASP Skövde

Bakterier Urin Semikvantitativ odling Negativ Växt

av…, CFU/mL Eskilstuna Stockholm

Campylobacter Faeces Specifik Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Corynebacterium

diphtheriae

Öppet sår, Abscess, Biopsi/

vävnad, Svalg, aterom mm

Specifik odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm ESBL RESISTENTA BAKTERIER Specifik odling på

kromagar

Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Stockholm Skövde

Endotoxin DIALYSVATTEN EIA

(Kinetisk kromatogen) Endosafe MCS IU/mL Eskilstuna

(3)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Haemolytiska streptokocker grupp A/C/G

Svalg Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Haemolytiska

streptokocker grupp B

Vagina, fostervatten, urin

mm Specifik odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Jästsvamp

Blod, led, pleuravätska, CSV, ascites, PD-vätska mm

Specifik Odling Bact/Alert3D (Blod,Led, Likvor)

Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde

Jästsvamp

BLOD/LED/LIKVOR/CVK Blod

Led

Cerebrospinalvätska CVK m.m.

Odling Bact/Alert Virtuo

(Blod,Led, Likvor)

Ingen växt.

Växt av… Stockholm

Jästsvamp

Cervix, uretra, Rektum/

anus, Vagina,

Prostatasekret, spiral mm

Specifik odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm

Jästsvamp Faeces Specifik Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Jästsvamp

Konjunktiva, Hornhinna, Främre kammare, Glaskropp

Specifik odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm

(4)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Jästsvamp

Nasopharynx, Bihåla/ sinus, Munhåla,

Näsöppning, Hörselgång, Mellanöra mm

Specifik odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Jästsvamp Sputum, Borstprov,

Trachealsekret, BAL mm Specifik odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm

Jästsvamp Urin Specifik odling Ingen växt av.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Jästsvamp

Öppet sår, Abscess, Biopsi/ vävnad, Implantat/

protes, aterom mm

Specifik odling Ingen växt av.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm MRSA Näsa, svalg, perineum, urin

mm

Specifik odling på kromagar

Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm Neisseria

gonorrhoeae

Cervix, uretra, Rektum/

anus, Vagina, Svalg, öga mm

Specifik odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm

Resistensbestämning Bakterier Diskdiffusion mm

Eskilstuna Skövde Stockholm

(5)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Resistensbestämning Bakterier, jästsvamp Etest mg/L

Eskilstuna Skövde Stockholm

Salmonella Faeces Specifik Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm

Shigella Faeces Specifik Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm

Yersinia Faeces Specifik Odling Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm

VRE Rektum, Faeces, perineum

mm

Specifik odling på kromagar

Ingen växt.

Växt av…

Eskilstuna Skövde Stockholm

(6)

Serologisk diagnostik

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Likvor (Serum)

EIA (Tecan

Evolyse)r)Gemini Combo - Skövde

LIAISON XL Skövde

Borrelia antikroppar IgG / IgM

Serum EIA

Euroimmun

Negativ Gränsvärde

Positiv Eskilstuna

CMV ak IgG Serum

Plasma CMIA Architect Negativ Positiv Skövde

CMV ak IgM Serum

Plasma CMIA Architect

Negativ Gränsvärde Positiv

Skövde

EBV ak IgG (EBNA) Serum

Plasma CMIA Architect Negativ

Gränsvärde Positiv Skövde

EBV VCA IgG Serum

Plasma CMIA Architect Negativ

Gränsvärde Positiv Skövde

EBV VCA IgM Serum

Plasma CMIA Architect Negativ

Gränsvärde Positiv Skövde Helicobacter pylori

antikroppar IgG Serum Kemiluminiscens Immulite 2000XPi E/mL Skövde

(7)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Eskilstuna

Serum Plasma CMIA Architect

Skövde Hepatit A

antikroppar IgM

Serum CMIA Advia Centaur XP

Negativ Gränsvärde

Positiv Stockholm

Serum Plasma CMIA Architect Negativ Positiv Eskilstuna

Skövde Hepatit A

antikroppar IgG

Serum CMIA Advia Centaur XP Negativ Positiv Stockholm

Serum Plasma CMIA Architect Negativ Positiv Eskilstuna

Skövde Hepatit B

coreantikroppar IgM

Serum CMIA Advia Centaur XP

Negativ Gränsvärde Positiv

Stockholm

Serum Plasma CMIA Architect

Negativ Reaktiv Positiv

Eskilstuna Skövde Hepatit B core

Antikroppar (anti-HBc)

Serum CMIA Advia Centaur XP Negativ Positiv Stockholm

Eskilstuna

Serum Plasma CMIA Architect IE/L

Skövde Hepatit B

surfaceantikroppar

(anti-HBs) Serum CMIA Advia Centaur XP IE/L Stockholm

Serum Plasma

CMIA Architect Negativ Positiv Eskilstuna

Skövde Hepatit B e- antikroppar

(anti HBe)

Serum CMIA Advia Centaur XP

Negativ Gränsvärde Positiv

Stockholm

(8)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Serum Plasma CMIA Architect Negativ Positiv Eskilstuna

Skövde Hepatit B e antigen

(HBeAg)

Serum CMIA Advia Centaur XP Negativ Positiv Stockholm

Hepatit B ytantigen (HBsAg)

inkl.blodgivarscreen

Serum Plasma CMIA Architect Negativ Positiv Eskilstuna

Skövde Hepatit B ytantigen

(HBsAg) Serum CMIA Advia Centaur XP Negativ Positiv Stockholm

Negativ Positiv Eskilstuna Hepatit C antikroppar

(screening)

inkl.blodgivarscreen

Serum Plasma CMIA Architect Negativ

Gränsvärde Positiv Skövde Hepatit C antikroppar

(screening) Serum CMIA Advia Centaur XP

Negativ Gråzon Reaktiv

Stockholm Hepatit C antikroppar

Verifikationstest Serum Plasma Immunoblot Negativ

Osäkert Positiv

Eskilstuna HIV-1 /HIV-2 Ag/Ab

Combo

(ej konfirmation) inkl.blodgivarscreen

Serum Plasma CMIA Architect Negativ Positiv Eskilstuna

Skövde

(9)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

HIV-1/HIV-2 Ag/Ab Combo (ej

konfirmation)

Serum CMIA Advia Centaur XP Negativ Positiv Stockholm

HTLV antikroppar screening

(ej konfirmation)

Serum Plasma CMIA Architect Negativ Positiv Eskilstuna

Skövde Eskilstuna Rubella antikroppar IgG Serum Plasma CMIA Architect

Negativ Gråzon

Positiv Skövde

Rubella antikroppar IgG Serum CMIA Advia Centaur XP

Ej Immun mot Rubella Ej säkert Immun mot Rubella

Immun mot Rubella.

Stockholm Syfilisantikroppar

(specifik)

Serum / Plasma/

Likvor Partikel agglutination Negativ / Positiv i titer… Skövde

Syfilis TP (specifik)

inkl.blodgivarscreen Serum / Plasma CMIA Architect Negativ / Positiv Eskilstuna

Skövde

Syfilisantikroppar Serum CMIA Advia Centaur XP

Negativ Gränsvärde

Positiv Stockholm

(10)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

TB-antigen,

Inteferon-gamma Blod EIA Tecan Evolyzer

Negativ

Negativt men nära detektionsgränsen Positiv

Positivt men nära detektionsgränsen Ej bedömbart

Eskilstuna

TBE IgGantikroppar Serum ELISA

Tecan Freedom EVOlyzer Enzygnost IgG

Negativ Svagt positiv Positiv

Skövde

TBE IgMantikroppar Serum ELISA

Freedom Evolyser (Hamilton)

RIDAscreen IgM

Negativ Svagt positiv Positiv

Skövde

(11)

Molekylärbiologisk diagnostik

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

AmpC Detektion av plasmidmedierad ampicillinresistens (pAmpC)

Isolat RealtidsPCR/

Smältpunktsanalys

MPCompact

Rotorgene Plasmidmedierad AmpC

PÅVISAD/ ej påvisad Skövde

Bordetella DNA

Svalg

Nasopharynxsekret Nedre luftvägar

RealtidsPCR/ probe

Qiasymphony MP96

MPCompact Rotorgene

B. pertussis PÅVISAD/ ej påvisad

B. parapertussis PÅVISAD/

ej påvisad

B. holmesii PÅVISAD/ ej påvisad

Skövde

Chlamydophila pneumoniae DNA

Svalg

Nasopharynxsekret Nedre luftvägar

RealtidsPCR/ probe

Qiasymphony MP96

MPCompact Rotorgene

C. pneumoniae PÅVISAD/

ej påvisad Skövde

RealtidsPCR/ probe

MPCompact MP96 Rotorgene

C.difficile toxingen PÅVISAD/ ej påvisad

Skövde Clostridium.difficile

toxingen A/B DNA Faeces

Xpert kassett

RealtidsPCR/ probe GeneXpert (Cepheid)

C.difficile toxin PÅVISAD/

ej påvisat /ej bedömbar Eskilstuna

(12)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Chlamydia trachomatis

DNA/RNA Urin

Cervix Vaginalprov

Aptima test Target capture, TMAmed detektion DKA

Panther (Hologic) C. trachomatis PÅVISAD/

ej påvisad / ej bedömbart

Skövde Eskilstuna Stockholm

Dermatofyt DNA

Nagel Hudskrap

RealtidsPCR/

Smältpunktsanalys

MPCompact MP96 Rotorgene

Dermatofyt PÅVISAD/ej påvisad

Trichophyton rubrum PÅVISAD/ej påvisad Trichophyton interdigitale PÅVISAD/ej påvisad

SKövde

(13)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

EHEC och övriga patogena E.coli

Faeces

Amplidiag Bacterial GE kit (Mobidiag) RealtidsPCR/

Probe

Qiasymphony MP96

MPCompact Rotorgene Amplidiag Analyzer Software (Mobidiag)

EHEC:

EHEC (stx1) ej påvisad/

PÅVISAD

EHEC (stx2) ej påvisad/

PÅVISAD

Patogena E. coli:

EHEC (stx1) ej påvisad/

PÅVISAD

EHEC (stx2) ej påvisad/

PÅVISAD

EPEC ej påvisad/

PÅVISAD/ ej bedömbart Shigella/EIEC ej påvisad/

PÅVISAD

ETEC ej påvisad/

PÅVISAD

EAEC ej påvisad/

PÅVISAD

Skövde

Fusobacterium

necrophorum DNA Svalg RealtidsPCR/ probe

Qiasymphony MP96

MPCompact Rotorgene

Fusobacterium

necrophorum PÅVISAD /ej påvisad

Skövde

(14)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Fecespanel bakterier Feces

Amplidiag Bacterial GE kit (Mobidiag) RealtidsPCR/

Probe

Qiasymphony MP96

MPCompact Rotorgene Amplidiag Analyzer Software (Mobidiag)

Salmonella ej påvisad/

PÅVISAD

Shigella/EIEC ej påvisad/

PÅVISAD

Yersinia ej påvisad/

påvisad

Campylobacter ej påvisad/

PÅVISAD

EHEC (stx1) ej påvisad/

PÅVISAD

EHEC (stx2) ej påvisad/

PÅVISAD

EPEC ej påvisad/

PÅVISAD / ej bedömbart ETEC ej påvisad/

PÅVISAD

EAEC ej påvisad/

PÅVISAD

Skövde

(15)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Faecespanel virus DNA/ RNA

Feces

Amplidiag Viral GE kit (Mobidiag)

RealtidsPCR/

Probe

MP96 MPCompact Rotorgene Amplidiag Analyzer Software (Mobidiag)

Norovirus (Genogrupp 1) PÅVISAD/ ej

påvisadNorovirus (Genogrupp 2) PÅVISAD/ ej

påvisad Sapovirus PÅVISAD/ ej påvisad

Adenovirus PÅVISAD/ ej påvisad

Rotavirus PÅVISAD/ ej påvisad

Astrovirus PÅVISAD/ ej påvisad

Skövde

HCV-RNA Serum Plasma

Aptima test, Target capture, Kvantitativ TMA, detektion med torches (fluorofor +

quencher)

Panther (Hologic)

HCV RNA Ej påvisat HCV RNA PÅVISAT: <10 IU/mL

HCV RNA PÅVISAT: 10- 100 000 000 IU/mL HCV RNA PÅVISAT:

>100 000 000 IU/mL

Eskilstuna

(16)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Herpes simplex 1/2 DNA

Blåsmaterial,

Ögonsekret RealtidsPCR/ probe

MP96

Qiasymphony Rotorgene

Herpes simplex typ 1 (HSV-1) PÅVISAD/ ej påvisad

Herpes simplex typ 2 (HSV-2) PÅVISAD/ ej påvisad

Skövde

Influensa A Influensa B RSV

Nasopharynxsekret Nasopharynxaspirat

Xpert kassett RealtidsPCR/

Probe

GeneXpert (Cepheid)

Influensa A PÅVISAD/ ej påvisad/ej bedömbar Influensa B PÅVISAD /ej påvisad

RSV PÅVISAD /ej påvisad/ej bedömbar

Skövde Eskilstuna Stockholm

Legionella

pneumophila DNA Nedre luftvägar RealtidsPCR/ probe

Qiasymphony MP96

MPCompact Rotorgene

L. pneumophila PÅVISAD Legionella-art PÅVISAD, dock ej L.pneumophila Legionella ej påvisad

Skövde

(17)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Luftvägspanel multiplex Ingående agens:

Influensa A Influensa B RSV

C. pneumonia M. pneumonia B. pertussis B.parapertussis

Nasopharynxsekret FilmArray kassett 2-stegs PCR Smältpunktsanalys

FilmArray (Biomerieux)

Influensa A PÅVISAD/ ej påvisad

Influensa B PÅVISAD/ ej påvisad

RSV (Respiratory Suncytical Virus) PÅVISAD/ ej påvisad Bordetella pertussis PÅVISAD/ ej påvisad Bordetella parapertussis PÅVISAD/ ej påvisad Chlamydophila pneumoniae PÅVISAD/ ej påvisad Mycoplasma pneumoniae PÅVISAD/ ej påvisad

Skövde Eskilstuna

MRSA konfirmation nuc/ mecA/ mecC/PVL

Isolat RealtidsPCR/ probe Rotorgene

Nuc gen PÅVISAD/ej påvisad

MecA gen PÅVISAD/ ej påvisad

MecC gen PÅVISAD/ ej påvisad

PVL-gen PÅVISAD/ ej påvisad

Skövde

(18)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

MRSA

konfirmation mecA/

mecC/ SCCmec Isolat Xpert kassett

RealtidsPCR/ probe

GeneXpert (Cepheid)

MRSA PÅVISAD /Ej

påvisad/Ej bedömbar Eskilstuna

Mycoplasma pneumoniae DNA

Svalg

Nasopharynxsekret

Nedre luftvägar RealtidsPCR/ probe

QiaSymphony MP96

MPCompact Rotorgene

M. pneumoniae PÅVISAD/

ej påvisad Skövde

Mycoplasma genitalium DNA/RNA

Urin Cervix Vaginalprov

Aptima test, Target capture, TMA

med detektion DKA

Panther (Hologic)

Mycoplasma genitalium PÅVISAD/ ej påvisad/ ej bedömbart

Skövde Eskilstuna Stockholm

Neisseria gonorrhoeae

DNA/RNA Urin, cervix, vaginalprov

Aptima test, Target capture, TMA

med detektion DKA

Panther (Hologic)

N. gonorrhoeae PÅVISAD/

ej påvisad/ ej bedömbart

Skövde Eskilstuna Stockholm

Norovirus (GI/GII) Feces Kräkning

Xpert kassett RealtidsPCR/ probe

GeneXpert (Cepheid)

Norovirus (Genogrupp 1) PÅVISAD/ ej påvisad/ej bedömbart

Norovirus (Genogrupp 2) PÅVISAD/ ej påvisad/ej bedömbart

Skövde Eskilstuna Stockholm

Varicella zoster MP96 Varicella zoster (VZV) Skövde

(19)

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

VRE screen vanA / vanB

Buljongodling av:

ALLMÄNNA PROVER såsom: Feces, Näsa, Svalg, Perineum, Sår, Urin mm

RealtidsPCR/ probe Rotorgene

Van A gen/Van B gen PÅVISAD,

Vancomycinresistent enterokock ej påvisad Se avdelningskommentar

Skövde

VRE konfirmation vanA

/ vanB Isolat RealtidsPCR/ probe Rotorgene

VanA-gen PÅVISAD/ ej påvisad

VanB-gen PÅVISAD/ ej påvisad

Skövde

(20)

Parasitologi

Komponent/

Undersökning System Metod / Mätprincip Utrustning Enhet Lab/ort

Cystor och maskägg Faeces Mikroskopi Mikroskop Negativt … påvisade

Eskilstuna Stockholm Skövde

Parasit DNA cystor (Cryptosporidium, Giardia, Entamoeba)

Faeces

Amplidiag Bacterial GE kit (Mobidiag) RealtidsPCR/

Probe

Qiasymphony MP96

MPCompact Rotorgene Amplidiag Analyzer Software (Mobidiag)

Cryptosporidium spp.

PÅVISAD/ ej påvisad Giardia intestinalis PÅVISAD/ ej påvisad Entamoeba

histolytica

PÅVISAD/ ej påvisad

Skövde

Verksamhet utanför de egna laboratorielokalerna, s.k. fältverksamhet, ingår inte i ackrediteringen.

Ackrediteringsomfattningen är flexibel enligt vad som anges i detta beslut. Det ackrediterade organet skall alltid kunna tillhandahålla en uppdaterad lista över den aktuella omfattningen för sin ackreditering.

References

Related documents

- De får gärna vara här, men de får absolut inte förstöra och skräpa ner och definitivt inte låta bli att plocka upp efter sig, säger Helen.. Händelsen senast

Vejde, krapp, safflor och färgreseda som historiskt varit betydelsefulla växter för färgväxtodling, kan fortsätta odlas i framtiden under förutsättning att odlingen kan ske på

Svenska Vitterhetssamfundets utgåva med sitt breddade textbestånd, sina melodier och belysande kommentarer öppnar vägen för ny framtida forsk- ning – om Dalin, men också

Det har ingenting alls med ironi att göra.”9 I en intervju från 2006 har Lugn vidare menat sig vara trött på sitt ti- digare bruk av ironi, och menat att ”i ironi finns alltid

När ett par år före Nobelpriset en kvinnlig debattör i bokform presenterade »den svenska feminismen» och härvid ägnade Selma Lagerlöf ett kapitel förklarade hon

Att det inte fanns någon signifikant skillnad i antal arter mellan den ekologiska odlingen och den konventionella i min studie skulle kunna bero på att den ekologiska odlingen

Produkten uppfyller kravspecifikationen och uppsatta önskemål. Där en trevlig design med enkla mjuka former som skulle kunna passa i många hem. Handhavandet har minimerats

This thesis represents the development of matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) mass spectrometry imaging (MSI) methods for single-plaque resolution spatial