Utbildningsplan
Masterprogram, systembiologi
Master's Programme, Systems Biology, 120 credits 120,0 högskolepoäng
Gäller för antagna till utbildningen fr o m HT10.
Utbildningens mål
Masterprogrammet i systembiologi, euSYSBIO, är ett Erasmus Mundus-program som ges i samarbete mellan tre europeiska universitet (partneruniversiteten): Helsinki University of Technology (TKK, Finland) och Instituto Superior Técnico (IST, Portugal).
Systembiologi definieras som studiet av interaktionerna mellan de olika komponenterna i ett biologiskt system och hur dessa interaktioner ger upphov till systemets funktioner och beteenden. Exempel på forskningsområden är studier av cancer och neurologiska och psykiatriska avvikelser.
Utbildningens övergripande mål är att ge studenterna en kombination av gedigna metodvetenskapliga kunskaper och praktisk erfarenhet av mättekniker så att de står redo att möta såväl dagens som framtida krav på en
professionell systembiolog.
Kunskap och förståelse
En master i systembiologi ska
ha en gedigen kunskap om datormodellering och systembiologi,
ha tillräckligt god förståelse av den underliggande biologin för att kunna tillämpa och tolka beräkningsmodeller inom systembiologi.
Färdigheter och förmågor
En master i systembiologi ska
ha praktisk erfarenhet av olika mättekniker inom systembiologi, kunna applicera metoderna i praktiskt forskningsarbete,
kunna utforma och implementera matematiska och statistiska modeller av komplexa beräkningssystem.
Värderingsförmåga och förhållningssätt
En master i systembiologi
kan göra bedömningar inom systembiologiområdet med hänsyn till relevanta vetenskapliga, samhälleliga och etiska aspekter,
har insikt om vetenskapens möjligheter och begränsningar, dess roll i samhället och människors ansvar för hur den används,
kan identifiera sitt eget behov av ytterligare kunskap och ta ansvar för sin kunskapsutveckling.
Härutöver gäller de liknande mål för masterexamen som definieras i högskoleförordningen.
1.
2.
3.
Utbildningens omfattning och innehåll
Programmet euSYSBIO-programmet omfattar 120 högskolepoäng, vilket vid normal studietakt motsvarar två år. Programmet är på avancerad nivå och ges på engelska.
Det första året kan läsas antingen vid KTH eller vid Helsinki University of Technology. Båda dessa universitet kan vara studentens hemuniversitet ("home university").
De teoretiskt inriktade kurserna under första året är relativt lika men med viss tonvikt på universitetets specialområde – i KTHs fall modellering av dynamiska fenomen och algoritmisk bioinformatik. Vid båda hemuniversiteten ingår även experimentellt inriktade kurser under det första året.
Det andra läsåret läses vid ett annat av de tre partneruniversiteten, som då kallas värduniversitet ("host university").
För det andra året finns följande tre spår, där KTHs spår är uppdelat på två delspår:
Science of Life Labs (KTH delspår 1), Computational Neuroscience (KTH delspår 2) Computational modelling in systems biology (TKK)
Systems Biology of Stress Response and Biotechnology (IST)
Varje spår består av en termin (30 ECTS-poäng) specialiseringskurser och en termin (30 ECTS-poäng) examensarbete.
I slutet av år 1 genomförs en gemensam muntlig examen av studenter från både KTH och TKK inför en gemensam kommission som utses av Konsortiet. Godkänt resultat i denna muntliga examen är en förutsättning för uppflyttning från år 1 till år 2.
Varje examensarbete i programmet har gemensam examination från resp. students hemuniversitet och värduniversitet.
Varje student får dubbel examen, dels från hemuniversitetet, dels från värduniversitetet.
Behörighet och urval
Grundläggande behörighetskrav: En väl genomförd kandidatutbildning (BSc, BEng eller motsvarande) omfattande 180 hp samt gedigna kunskaper i skriven och talad engelska. Dokumentation av genomförd kandidatutbildning enligt KTHs gängse krav.
Särskilda behörighetskrav: Förkunskapskraven för masterprogrammet i systembiologi är
Kandidatexamen ska vara från ett universitet listat i senaste utgåvan av International handbook of universities http://www.unesco.org/iau/onlinedatabases/list.html
Examen ska innefatta kurser i flervariabelanalys (multivariate calculus), linjär algebra (linear algebra) och datalogi inklusive programmering (computer science including programming).
Sökande skall visa nödvändiga kunskaper i engelska medelst resultat från ett internationellt accepterat test. För TOEFL pappers-baserat test är minimikraven ett totalresultat om 580 med betyg 4 för den skrivna delen av testet. För TOEFL internet-baserat test är minimikraven totalresultat 92 med betyg 22 för den skrivna delen av testet. För TOEFL dator-baserat test är minimikraven totalresultat 237 med betyg 4 för essä-delen. För IELTS är minimikraven ett totalresultat 6.5 där den skrivna måste vara minst 5.5 och ingen del för vara lägre än 5.0. För University of Cambridge/Oxford Certificate i "Advanced English", eller "Certificate of Proficiency" eller "Diploma of English Studies" är minimikravet betyg C.
Undantag från kravet att visa nödvändiga kunskaper i engelska medelst resultat från ett internationellt accepterat test medges för sökande med genomförd kandidatexamen från ett universitet där all undervisning sker på engelska och som fysiskt befinner sig i något av följande länder: USA, Kanada, Storbritanien, Irland, Australien och Nya Zeeland.
Dokumentation av att de särskilda behörighetskraven är uppfyllda ska göras enligt KTHs gängse krav samt de krav gällande sökande från vissa länder som listas på http://www.kth.se/eusysbio.
Urval: Urval av sökande till masterprogrammet i systembiologi görs av Konsortiets styrgrupp.
Urvalet av sökande baseras på en sammanlagd värdering av följande: universitet, innehållet i examen/examina, studieframgång, personligt brev, referenser, relevant arbetslivserfarenhet, publikationer (inklusive vetenskapliga posters etc.) och kunskaper i engelska språket.
Sökande uppmanas att till ansökan bifoga GRE (Graduate Examination score) för att underlätta bedömningen av hur den sökande uppfyller urvalskriterierna.
Utbildningens genomförande
Utbildningens upplägg
Utbildningen innefattar dels terminer vid varje partneruniversitet, dels horisontell integration mellan studenter på samma årskurs vid olika partneruniversitet, och dels vertikal integration mellan studenter på de två
årskurserna. Terminerna vid KTH läses enligt ordininarie schema, där läsåret omfattar 40 veckor. Vid behov kan undervisning läggas utanför läsåret.
Programmet ordnar en årlig vinterskola, bekostad av konsortiet. Till vinterskolan inbjuds även ett antal lärare från partnerna i konsortiet och några internationella föreläsare.
Horisontell integration på första årskursen utförs med utbyte (gästbesök) mellan Stockholm och Helsingfors, genom deltagande i programmets vinterskola samt genom en gemensam muntlig examination av samtliga studenter från KTH och TKK. Horisontell integration på andra årskursen utförs genom deltagande i programmets vinterskola.
Vertikal integration utförs genom att samtliga studenter deltar i programmets vinterskola och genom gemensam examination av examensarbeten mellan studenternas hemuniversitet och värduniversitet.
Uppföljning av utbildningen Konsortiet kommer att följa samtliga studenter i programmet, vid vilket universitet de än studerar enligt följande delar: mobilitet (var de fysiskt befinner sig), studieresultat, frågeformulär ang.
programmet, (ifrågavarande fall) stipendieutbetalningar inklusive reseersättningar, examensbevis (diploma supplement) och examina. Data i dessa delar kommer att enligt kontraktet rapporteras till Executive Agency (EACEA).
Konsortiet kommer vidare att genomföra och sammanställa såväl studenternas som lärarnas utvärderingar av dels programmet i sin helhet, dels varje enskild kurs. Data i dessa delar kommer att enligt kontraktet rapporteras till Executive Agency (EACEA).
Konsortiet kommer vidare att i samverkan med KTHs övriga Erasmus Mundus II masterprogram utveckla interna utvärderingsverktyg och sätt att genomföra extern utvärdering av programmet. Data i dessa delar kommer att enligt kontraktet rapporteras till Executive Agency (EACEA).
Läsåret för KTH:s grundutbildning är indelat i fyra perioder. Läsperioderna har vardera ca sju veckor med minst 33 läsdagar. Varje läsperiod följs av en tentamensperiod. Utöver de fyra ordinarie tentamensperioderna ges tre omtentamensperioder; efter jul, efter läsårets sista ordinarie tentamensperiod och direkt före läsårets första läsperiod.
Läsårsindelningen vid KTH framgår av studentwebben http://www.kth.se/student/schema/1.1007
Kurser
Utbildningen sker i kursform. Kurslistor finns i bilaga 1.
Utbildningen sker också i form av tutoring, genom utbyte mellan Stockholm och Helsingfors (år 1) och genom
Examination görs på många sätt, till exempel med hemuppgifter som redovisas muntligt eller skriftligt, laborativt arbete, projektarbete eller traditionella skriftliga tentor.
Efter varje KTH-kurs hämtas studenternas synpunkter in och analyseras av kursledaren i en kursanalys som normalt publiceras på webben, se KTHs regler för kursanalys
http://intra.kth.se/regelverk/utbildning-forskning/grundutbildning/kursanalys
Betygssystem
För kurser på KTH används en sjugradig målrelaterad betygsskala A-F som slutbetyg för kurser på grundnivå och avancerad nivå. A-E är godkända betyg med A som högsta betyg. Betygen godkänd (P) och underkänd (F) används som slutbetyg då särskilda skäl föreligger.
Partneruniversitet kommer att ange betyg såväl med det egna betygssystemet som enligt ECTS user's guide.
Villkor för deltagande i utbildningen
Studenterna är skyldiga att följa de anvisningar som gäller för det universitet där de bedriver sina studier. Konsortiet ställer som gemensamt krav för uppflyttning till årskurs 2 att studenterna godkänts i gemensam muntlig examination från KTH och TKK.
Tillgodoräknanden
Student vid KTH har möjlighet att ansöka om att få tillgodoräkna sig resultat från kurs/kurser vid annan högskola/universitet inom eller utom landet. Blankett finns på KTHs studentwebb.
Ansökan om tillgodoräknande lämnas till studievägledningen vid CSC.
KTHs policy för tillgodoräkning finns i sin helhet i KTH-handboken.
http://intra.kth.se/regelverk/utbildning-forskning/grundutbildning/prestationer/1.27200
Utlandsstudier
Årskurs 1 läses vid hemuniversitetet i ett land och årskurs 2 vid värduniversitetet i ett annat land.
Examensarbete
Studenter inom euSYSBIO-programmet ska göra ett individuellt examensarbete som motsvarar 30 hp.
Syftet med examensarbetet är att studenten ska visa förmåga att självständigt utföra ett projektarbete genom att använda de kunskaper och färdigheter som hon/han fått genom programmets kurser. Examensarbetet utförs vid värduniversitetet och handleds av lärare från både hemuniversitetet och värduniversitetet. Uppgiften för
examensarbetet kan vara teoretisk eller tillämpad och fokusera på forskning, implementation eller tillämpningar.
Uppgiften kan hämtas från akademi eller industri.
Konsortiet kommer att sträva efter harmonisering mellan partneruniversiteten vad gäller betygssättning av examensarbeten och samråd kommer alltid att ske mellan handledare från hemuniversitet och värduniversitet vad gäller betygssättning av varje enskilt examensarbete. Betygssättning av examensarbeten i vardera av de två examina som varje student erhåller från sitt resp. hemuniversitet och värduniversitet kommer att ske enligt resp.
universitets riktlinjer och föreskrifter, där dock hänsyn tagits till det samråd mellan handledarna som förutsätts ha skett.
KTHs övergripande regler och riktlinjer för examensarbete 30 högskolepoäng för masterexamen, samt betygssättning av examensarbete finns i KTHs regelverk:
http://intra.kth.se/regelverk/utbildning-forskning/grundutbildning/examensarbete/1.27212
Examen
Studenter med KTH som hemuniversitet eller värduniversitet kan ansöka om teknologie masterexamen, engelska: Degree of Master of Science (two years).
Anvisningar för hur ansökan om examen görs finns på KTHs studentwebb.
Bilaga 1 - Kurslista
Bilaga 2 - Inriktningsbeskrivningar
Bilaga 1: Kurslista
Masterprogram, systembiologi (TSYBM), Utbildningsplan för kull HT10
Gemensamma kurser Årskurs 1
Obligatoriska kurser (58.0 hp)
Kurskod Kursnamn hp Utb. nivå
BB1110 Genteknik och molekylärbiologi 7.0 Grundnivå
BB2160 Strukturbiologi 7.5 Avancerad nivå
DD2397 Tillämpad bioinformatik 7.5 Avancerad nivå
DD2398 Kvantitativ systembiologi 7.5 Avancerad nivå
DD2399 Omikdata och systembiologi 7.5 Avancerad nivå
DD2435 Neuronnäts- och biomodellering 9.0 Avancerad nivå
DD2450 Algoritmisk bioinformatik 6.0 Avancerad nivå
SK2530 Introduktion till biomedicin 6.0 Avancerad nivå
Kompletterande information
De studenter som studerar första året vid KTH läser nedanstående kurser. Utöver nedanstående kurser
tillkommer kursen "What is life? The future of biology" som är en doktorandkurs på 2 hp som ges av Karolinska institutet.
Årskurs 2
Obligatoriska kurser (55.5 hp)
Kurskod Kursnamn hp Utb. nivå
BB2290 Molekylär biomedicin
Obligatorisk för spåret Molecular systems biology
7.5 Avancerad nivå
BB2510 Proteomik
Obligatorisk för spåret Molecular systems biology
6.0 Avancerad nivå
DD225X Examensarbete inom biomedicinsk teknik, avancerad nivå 30.0 Avancerad nivå
DD2380 Artificiell intelligens
Obligatorisk för spåret Computational neuroscience och valfri för spåret Molecular systems biology
6.0 Avancerad nivå
DD2436 Modellering av cellbiologiska processer
Obligatorisk för spåret Computational neuroscience
6.0 Avancerad nivå
Villkorligt valfria kurser
Kurskod Kursnamn hp Utb. nivå
BB2280 Molekylär modellering
Valfri för spåret Molecular systems biology
7.5 Avancerad nivå
BB2470 Genetik och genomik
Valfri för spåret Molecular systems biology
10.0 Avancerad nivå
DD2435 Neuronnäts- och biomodellering
Valfri för spåret Computational neuroscience
9.0 Avancerad nivå
DD2458 Problemlösning och programmering under press Valfri för spåret Molecular systems biology
9.0 Avancerad nivå
DD3007 Beräkningsbaserad modellering inom aktuell neurovetenskap Valfri för spåret Computational neuroscience
3.0 Forskarnivå
SF2940 Sannolikhetsteori
Valfri för spåret Molecular systems biology
7.5 Avancerad nivå
SI2700 Proteinfysik
Valfri för spåret Molecular systems biology
7.5 Avancerad nivå
SK2520 Experimentella metoder inom molekylär biofysik Valfri för spåret Molecular systems biology
8.0 Avancerad nivå
Kompletterande information
Denna information gäller de studenter som läser årskurs 2 vid KTH.
Studenten väljer ett av två spår: Molecular systems biology och Computational neuroscience. Inom spåret ska studenten läsa kurser om 30 hp. Examensarbete om 30 hp ska genomföras.
För mer information se
http://www.kth.se/studies/master/em/eusysbio/programme/1.42684?l=en
För spåret Molecular systems biology tillkommer bland den obligatoriska kursen:
2001 What is life? The future of biology, 2 hp, doktorandkurs som ges av Karolinska instituitet och bland de valfria
2384 Cancer systems biology,1,5 hp, doktorandkurs som ges av Karolinska institutet.
För spåret Computational neuroscience tillkommer bland de obligatoriska kurserna:
2QA040 Neuroscience part 1: from ion channel to behaviour, 15 hp (Jan. 2011 ännu ej inrättad) och bland de valfria
2233 Introduction to cognitive neuroscience, 3 hp, doktorandkurs som ges av Karolinska institutet.
Bilaga 2: Inriktningar
Masterprogram, systembiologi (TSYBM), Utbildningsplan för kull HT10
Programmet har inga inriktningar.
